TV2003重制版是為慶祝EVA企業(yè)十周年而重置的版本畫面和音效都有提升在TV95版的基礎上重制了21-24四話重制的部分稱作“Video”加上原有的26集03版共26話一共30集這個版本中21與2223與2425與2627與28都是相同的內(nèi)容只不過21232527和原來一樣而22242628中增添了一些新的東西突襲世界的大災難“第二次沖擊”后世界在廢墟之上重建14歲的少年碇真嗣被父親碇元渡叫到第3新東京市本以為能見到父親迎接的他卻見到名為“使徒”的巨大生物與軍隊交火危急之下特務機關NERV的葛成美里將真嗣救下并將其帶往碇元渡所統(tǒng)領的NERV總部但迎接真嗣的卻是是父親冷酷地命令:駕駛稱為“EVA”的巨大人型機器人與使徒戰(zhàn)斗本已表示拒絕的真嗣看到重傷的替補駕駛員綾波麗后決定遵從父親的命令就這樣從未受過作戰(zhàn)訓練的真嗣準備駕駛EVA初號機迎戰(zhàn)使徒不斷襲來的使徒身份不明的綾波麗從德國來的駕駛員惣流·明日香·蘭格蕾14歲的少年要面對遠超自己能力的挑戰(zhàn)而碇元渡不動聲色地觀察一切一個稱為“人類補完計劃”的神秘計劃正在按照他的計劃實現(xiàn)