正享受短暫假期的公安九課少校草薙素子(坂本真綾 配音)突然接到巴特(松田健一郎 配音)的報告西之內某處大廈遭受恐怖分子襲擊政府高官和商業(yè)巨擎被人殺害在草薙的指揮下九課的石川、波瑪、帕茲、巴特等人通力合作將恐怖分子徹底制服但草薙在行動(dòng)中意外受到神秘病毒感染在西之內恐怖襲擊的同時(shí)遠郊的水壩發(fā)生爆炸案新濱縣刑警陀古薩(新垣樽助 配音)傳喚水壩管理企業(yè)負責人沙特博士對方是來(lái)自飽經(jīng)戰火的卡森共和國的卡爾迪斯人受警方高層施壓陀古薩沒(méi)有得到任何有用信息另一方面草薙一方得知恐怖分子的真實(shí)身份正是卡爾迪斯的游擊隊組織兩起案件意外聯(lián)系在一起其背后隱藏怎樣的真相 本片根據士郎正宗的原作改編為攻殼機動(dòng)隊前傳“ARISE”的第三部